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科研智能體為高效育種精準篩選基因

AI育種,迎來“基因科學(xué)家”(探一線)

本報記者 黃曉慧

2025年10月26日07:58    來源:人民網(wǎng)-人民日報222

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  “我們這些田間地頭的育種人,也用上AI科技了?!苯?,“豐登”聯(lián)合研發(fā)團隊收到了廣西大學(xué)從事水稻分子育種的科研人員黃福鋼發(fā)來的感謝消息。

  2024年4月,由上海人工智能實驗室、崖州灣國家實驗室、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)等科研單位組成的聯(lián)合研發(fā)團隊,發(fā)布“豐登·種業(yè)大模型”。經(jīng)過科研攻關(guān),研究團隊在大模型的基礎(chǔ)上于今年7月推出生物育種領(lǐng)域的科研智能體——“豐登·基因科學(xué)家”,輔助科研人員探索和驗證未知的基因功能。

  作物育種的關(guān)鍵在于通過基因組精準設(shè)計優(yōu)化農(nóng)藝性狀。自2005年水稻全基因組測序完成以來,多國投入大量資源致力于基因功能解析,但進展緩慢。傳統(tǒng)育種研究高度依賴專家經(jīng)驗,從提出假設(shè)、設(shè)計實驗到驗證結(jié)論,往往需耗時數(shù)年,且成功率有限。

  “這就像面對一本寫滿未知符號的天書,我們只能零星破譯幾個字符,育種效率難以提升?!毖轮轂硣覍嶒炇已芯繂T、“豐登”項目聯(lián)合負責(zé)人楊帆說,育種歷史記錄數(shù)據(jù)、作物生物測序數(shù)據(jù)、農(nóng)田環(huán)境數(shù)據(jù)和種養(yǎng)管理數(shù)據(jù)等關(guān)鍵數(shù)據(jù)事關(guān)育種成敗,“尤其是近年來極端氣候事件頻發(fā),農(nóng)田環(huán)境條件和作物生產(chǎn)模式已與過去大不相同,依靠人工經(jīng)驗的育種成功率更加有限”。

  如何讓AI學(xué)會像育種專家一樣思考?研究團隊用海量數(shù)據(jù)訓(xùn)練智能體,使其具備精準識別基因與性狀的關(guān)系、“基因—性狀”關(guān)聯(lián)預(yù)測、育種實驗推理與設(shè)計的能力。水稻版本“豐登·種業(yè)大模型”自今年5月向全球開放以來,已有來自國際水稻研究所、印度中央水稻研究所等國際權(quán)威育種機構(gòu)使用。

  楊帆說,通過對基因功能的快速解析,育種科研人員可更精準地組合優(yōu)良等位基因,實現(xiàn)定制化育種目標——既包括高產(chǎn)、抗病、抗逆等傳統(tǒng)性狀,也可涵蓋營養(yǎng)強化、風(fēng)味改良等新需求。

  “這不僅是在教AI育種知識,更是在傳授科學(xué)發(fā)現(xiàn)的方法?!鄙虾H斯ぶ悄軐嶒炇已芯繂T、“豐登”項目聯(lián)合負責(zé)人董楠卿表示,“我們要讓AI學(xué)會如何讀懂育種科學(xué)家的需求、找到匹配的基因,設(shè)計實驗、驗證結(jié)論,甚至自我糾錯?!?/p>

  通過強化學(xué)習(xí)訓(xùn)練,“豐登·基因科學(xué)家”逐步具備一定的“科研能力”。它能夠模擬專家推理過程,自動完成從提出假設(shè)、設(shè)計實驗到分析結(jié)果的完整流程。在驗證中,研究團隊選取了水稻、玉米的數(shù)十個未報道基因,除具體實驗操作外,關(guān)鍵科研決策由“豐登”向科研人員提供。

  在水稻研究中,“豐登”發(fā)現(xiàn)了多個基因的新功能——有的通過調(diào)控植物激素影響株高,有的與光合效率密切相關(guān);在玉米研究中,“豐登”精準預(yù)測出與株高、穗位等性狀相關(guān)的候選基因,與田間試驗結(jié)果高度一致。

  “豐登·基因科學(xué)家”只是起點。研究團隊表示,下一步系統(tǒng)將持續(xù)融入更多作物數(shù)據(jù)、環(huán)境數(shù)據(jù)和育種知識,向覆蓋全物種、全流程的智慧育種平臺演進。

  《 人民日報 》( 2025年10月26日 05 版)

(責(zé)編:彭曉玲、代曉靈)
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